Belirtileri bastırmak yerine, hastalığın arkasındaki nedenleri analiz eder. Vücutta sistemlerin birbiriyle nasıl etkileşimde bulunduğuna odaklanır. Beslenme, yaşam tarzı, genetik yapı ve çevresel etkenler birlikte değerlendirilir.
Bu yaklaşım, özellikle kronik hastalıklarla mücadelede etkili olur. Fonksiyonel tıpta amaç, yalnızca hastalığı kontrol altına almak değil, hastanın genel sağlık durumunu kalıcı şekilde iyileştirmektir. Hastalıklar, izole değil birbiriyle bağlantılı süreçlerin sonucu olarak değerlendirilir. Bu da çok yönlü bir değerlendirme ve tedavi süreci anlamına gelir.